Genotipado
Por medio de las técnicas de genotipado, se pueden visualizar uno o múltiples fragmentos de ADN amplificados simultáneamente, de este modo se obtienen patrones de bandas que pueden ser específicos para cada especie (variabilidad interespecífica) o que presenten una variabilidad entre los individuos de una determinada especie (variabilidad intraespecífica).
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Análisis de fragmentos (microsatélites)
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Otros análisis: AFLPs, SNPs, SnapShot, BAC-fingerprinting...
Fluoróforos que se puedan usar para el marcaje de los fragmentos
Dyes
Max A (nm)
Max E (nm)
Intensidad Real
JOE ™
528
554
100
HEX ™
535
553
50
VIC ®
538
554
100
NED ™
546
575
40
Cy3C
550
550
570
PET ®
558
595
25
ROX ™
587
607
12
Matriz empleada por Secugen en función de la combinación de fluoróforos seleccionada por el cliente
Matriz
Azul
Verde
Amarillo
Rojo
Naranja
Utilidad
D
6-FAM™
HEX™
NED™ / CY3C
ROX™
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Genotipado/Microsatélites
G5
6-FAM™
VIC ®
NED™
PET ®
LIZ ®
Genotipado/Microsatélites
E5
dR110
dR6G
dTAMRA™
dROX ™
LIZ ®
SNaPshot