Secugen - Identificación Hongos y Bacterias
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Secugen - Otros Servicios - Identificación Hongos/Bacterias

Cultivo microorganismos

Identificación bacteriana a través de las secuencias del gen del ARN 16S.


Una de las maneras mas exactas de asignar una bacteria a un grupo taxonómico es a través del estudio de la secuencia del gen del ARN 16S. Para ello es necesario amplificar por PCR, mediante el uso de cebadores que son homólogos a regiones muy conservadas, un fragmento que contenga una región variable que permita asignar el especimen al grupo taxonómico más próximo mediante comparación de la secuencia con las bases de datos disponibles.

Identificación fúngica a través de las secuencias de las regiones ITS1, ITS2 y del gen ARN 5.8S


Una de las técnicas más usadas para la identificación taxonómica de hongos es la secuenciación de las regiones ITS. Para ello es necesario amplificar por PCR, mediante el uso de cebadores que son homólogos a regiones muy conservadas, un fragmento que contenga una región variable que permita asignar el especimen al grupo taxonómico más próximo mediante comparación de la secuencia con las bases de datos disponibles. La zona amplificada contiene las regiones ITS1 y 2 y el gen del ARN5.8S

Identificación clonal de bacterias y hongos a través del ADN


Debido a la potencia de la técnica de identificación microbiologica por técnicas de secuenciación, ésta es usada para la identificación clonal. Así, la agencia estadounidense FDA recomienda la identificación genotípica de microorganismos, además de las técnicas microbiológicas, en las guía de buenas prácticas de fabricación (September 2004 cGMP). Del mismo modo la Farmacopea Española recoge una norma similar en la que apunta que para identificar el origen clonal de un microorganismo puede ser necesario usar técnicas de secuenciación de ADN, por la mayor sensibilidad frente a las técnicas microbiológicas o bioquímicas.

Estos servicios se prestan a partir de ADN purificado, muestra depositada en papel FTA o desde colonia crecida en placa de agar.

Si necesita algún servicio específico, que no aparezca en la web, no dude en contactar con nosotros para valorar conjuntamente la posibilidad de ofrecérselo.