Secugen - Ruido Fondo
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Secugen - Soluciones Técnicas - Ruido de fondo

Aspecto de la secuencia.

  • La secuencia tiene fondo, aparecen picos dispersos debajo de la secuencia principal junto con "Ns" dispersas por la secuencia. Baja señal del dato crudo.

Ejemplo.

Fondo

ruido de fondo

Causas posibles.

  • La causa más común para esto es que la baja señal por encima del fondo se deba a una cantidad insuficiente de molde o cebador o a una reacción ineficiente de secuenciación debido a la inhibición de la ADN polimerasa. Un caso típico es el arrastre de trazas de etanol en la purificación del molde.

Tratamiento.

  • Cuantificar de manera adecuada el molde y el cebador, estar seguro de que no ha habido arrastre de solventes orgánicos en la purificación.