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Secugen - Soluciones Técnicas - Desfase después de región homopolimérica

Aspecto de la secuencia.

  • La calidad de la secuencia disminuye después de repeticiones de alrededor de 10 unidades de la misma base. A partir de este punto se observa doble secuencia.

Ejemplo.

Stuttering

desfase region homopolimerica

Causas posibles.

  • Desfase de la polimerasa durante la síntesis de ADN. Este es un efecto conocido de la secuenciación Sanger.

Tratamiento.

  • Secuenciar desde la otra hebra.
  • Usar un primer polimononucleotidico con una base degenarada en el extreme 3´. Solo sirve para las As y Ts.